广东省将自考纳入诚信档案后，对参加自学考试但最终缺考的考生有着重要影响。缺考对考生的毕业时间产生明显的影响，严重的情况下甚至会限制考生的报考次数。
一次缺考将导致毕业时间延长半年以上，可能面临重新学习因为自考科目或教材在下一次考试时已经更改的情况。广东省要求考生自愿在下一期自学考试中报考不超过2门课程，如果连续缺考2门课程或以上，就需要等到下次有这门课程考核的机会。
若缺考的是公共课程，下个考期仍可继续考试，但如果是专业课程，只能等到下次有这门课程考核的时候了。这些限制政策对考生的自学考试计划和进度都会带来一定的挑战。
