江西自考毕业论文申请的次数有限，每年只有两次机会。对于自考本科生而言，毕业申请的前提是要撰写一篇毕业论文，并通过答辩。只有在论文答辩成绩合格之后，才能正式申请毕业。
自学考试的科目设置分为几类。首先是公共基础课，这些课程是所有专业或同类专业的考生都必须参加的，如马克思主义基本原理概论、中国近代史纲要、英语等。尽管这些课程不一定与所学专业直接相关，但它们对于培养全面发展的人才、提供方法论是至关重要的。
其次是专业基础课，即考生必须学习的基础理论、基本知识和技能课程。这些课程旨在使考生掌握专业知识和科学技术，为其进一步学习其他内容打下坚实基础。比如，工商企业管理专业的《管理学原理》和电子商务专业的《电子商务基础与应用》就属于专业基础课。
此外，还有专业课，这些课程与所学专业的知识和技能直接相关。最后是选修课，学生可以在规定的课程范围内进行有限制的选择，根据个人能力和兴趣选择想要考取的科目。
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